Ūdens kvalitātei ir būtiska ietekme uz akvakultūru. Tāpēc akvakultūrai ir īpaši svarīgi pārzināt noteikšanas rādītājus, veikt regulāras ūdens kvalitātes pārbaudes un savlaicīgi reaģēt uz ūdens kvalitātes rādītāju korekcijām.
Galvenie akvakultūras ūdeņu testēšanas vienumi ir pH, amonija slāpeklis, izšķīdušais skābeklis, nitrīti, sulfīdi un sāļums. Starp tiem izšķīdušais skābeklis un pareizs pH ir būtiski nosacījumi, savukārt amonija slāpeklis, nitrītu slāpeklis un sulfīdi ir galvenās toksiskās vielas, ko rada zivju un garneļu metabolisms. Precīza un savlaicīga šo vielu koncentrācijas mērīšana un atbilstošu pasākumu veikšana var ievērojami uzlabot zivju un garneļu izdzīvošanas rādītājus un samazināt audzēšanas izmaksas.